传说中的仙岛并非全然虚无缥缈，岛屿确实存在。日本的文献记载中，徐福所指的正是日本的本州、四国、九州三岛。尽管日本文字史料中关于徐福的描述模糊不清，但这并不能怪罪于日本人。因为在徐福登陆的时代，日本尚未有可靠的文字记载。部分日本史学界人士认为，徐福即是日本古代的著名君主——神武天皇。据传，他登陆的地点位于日本的关西平原，而所谓的“神武东征”横扫日本的传说，便基于徐福登陆日本后南征北战的英勇事迹。
日本人的思维独树一帜，他们在研究徐福问题时，观点也独具个性。通过考古发现，他们分析了古代墓葬遗骨，发现在徐福东渡时期，日本关西地区的居民平均身高突然增加了5厘米。他们推断这可能是徐福及其部属登陆后带来的局部人种改良。还有一个引人瞩目的现象，即日本科学家发现日本人的基因中有1%来自中国的云南地区。而且，日语的发音与云南纳西族的语音有着许多相似之处。
这一切的背后原因是什么呢？或许可以从徐福东渡的历史记载中寻找答案。据中国史书记载，徐福要求的三千童男童女，秦始皇无法立即凑齐。恰逢秦军征服了西南夷，于是秦始皇下令这些被征服的部族提供所需的童男童女。西南夷，即是现代云南各民族的共同祖先。如果这些西南夷的后代随着徐福东渡融入日本，那么给日本人带来1%的云南基因便有据可循了。这样的历史交融，不仅丰富了日本的人种基因，也为我们揭示了中日两国深厚的历史渊源。
