从进宫的那一刻起，珍妃与宫中重要人物之间的关系就持续紧张，特别是与慈禧太后，两者之间的不和似乎成为了无法调和的矛盾。慈禧太后深怕自己唯一的侄女隆裕皇后的地位受到珍妃的威胁，忧心忡忡。怕什么来什么，珍妃的出现确实让隆裕皇后在光绪帝心中的地位逐渐减弱。
慈禧太后原本的计划是让自己的侄女独自占据后宫，待诞下皇子后，再为光绪帝引入其他妃子。那时，自己的侄女已有嫡长子，地位稳固如泰山。即使后来引入了其他妃子，也无法撼动隆裕皇后及其子嗣的地位。在众臣的劝说下，慈禧太后最终接纳了珍妃姐妹入宫。
珍妃的受宠让慈禧太后倍感压力，每当心情不佳时，更是会无端找珍妃的茬。有一次，珍妃在不知情的情况下触怒了慈禧太后。当时正值中日甲午战争之后，慈禧太后因求和于日本并签订不平等条约而心情极度恶劣。当珍妃姐妹在此时笑着进入宫殿时，慈禧太后愤怒至极，下令对她们进行惩罚。
廷杖之刑残酷无比，慈禧太后甚至下令扒去珍妃姐妹的衣物，以达到羞辱的目的。光绪帝虽然在场，却并未进行求情。他知道，一旦为珍妃姐妹求情，只会进一步激怒慈禧太后，后果不堪设想。就这样，珍妃姐妹被毫无遮拦地各打了十大板。
在电视剧《喜来乐》中，有一个情节与这个故事背景相似。喜来乐被请入皇宫为一位被慈禧太后责打的妃子治病。宫中的御医们都知道这件事，却无人敢前去诊治，因为他们害怕得罪慈禧太后。他们深知，得罪光绪帝或许还能保命，但得罪慈禧太后则可能招致满门抄斩之灾。在整个时期，珍妃姐妹可能是遭受这种待遇的唯一两位妃子。
